การติดเชื้อแบบถาวรเกิดขึ้นเนื่องจากร่างกายไม่สามารถกำจัดสิ่งมีชีวิตได้หลังจากการติดเชื้อครั้งแรก การติดเชื้อแบบถาวรมีลักษณะเป็นการมีอยู่อย่างต่อเนื่องของสิ่งมีชีวิตที่ติดเชื้อ มักจะเป็นการติดเชื้อแบบแฝงพร้อมกับการกลับเป็นซ้ำของการติดเชื้อที่ใช้งานอยู่เป็นครั้งคราว มีไวรัสบางชนิดที่สามารถรักษาการติดเชื้อได้อย่างต่อเนื่องโดยทำให้เซลล์ต่างๆ ของร่างกาย ติดเชื้อ ไวรัสบางชนิดที่ได้รับมาจะไม่ออกจากร่างกาย ตัวอย่างทั่วไปคือไวรัสเริม ซึ่งมักจะซ่อนตัวอยู่ในเส้นประสาทและกลับมาทำงานอีกครั้งเมื่อมีสถานการณ์เฉพาะเกิดขึ้น การติดเชื้อแบบถาวรทำให้มีผู้เสียชีวิตหลายล้านคนทั่วโลกในแต่ละปี การติดเชื้อเรื้อรังจากปรสิตทำให้เกิดความเจ็บป่วยและการเสียชีวิตสูงในประเทศด้อยพัฒนาหลายแห่ง